Conform REGULAMENTULUI DE ORGANIZARE A ACTIVITĂŢII FOTBALISTICE, articolul 56, anexa 1, în anul competiţional 2006-2007, Liga a 3-a, compusă din 6 serii a câte 18 echipe, se va desfăşura după următorul regulament :

1.      Promovează în Liga a 2-a :

a)      echipele clasate pe primul loc în fiecare din cele 6 serii ale Ligii a 3-a ;

b)      alte două echipe, clasate pe locul doi în seriile respective, care au câştigat turneele de baraj ;

2.      Retrogradează în Liga a 4-a un număr de 21 de echipe, astfel :

a)      echipele clasate pe locurile 18, 17 şi 16 în fiecare serie ;

b)      alte trei echipe cel mai slab clasate pe locul 15 ; pentru determinarea acestora se alcătuiesc clasamente separate, numai pe baza rezultatelor obţinute de cele 6 echipe de pe locul 15, cu cele de pe locurile 1-14 din seriile respective;

3.      Promovează în Liga a 3-a un număr de 21 de echipe clasate pe primul loc în campionatele Ligii a 4-a, care au caştigat jocurile de baraj ;

4.      Echipele din Liga a 3-a care retrogradează sunt obligate să realizeze baremul de 25 de puncte ;

5.      Echipele retrogradate din Liga a 3-a, care nu realizează baremul, vor fi penalizate în campionatul următor, când vor activa în Liga a 4-a, cu diferenţa dintre punctele realizate şi cele stabilite prin barem ;

6.      În cazul retragerii sau excluderii uneia sau a mai multor echipe din campionatul Ligii a 3-a, înainte de sfârşitul turului, baremul de puncte care trebuie realizat de echipele retrogradate se reduce procentual, în funcţie de numărul de echipe retrase sau excluse .